本实用新型涉及一种牙椅管路清洗消毒器，包括水箱，水箱包括箱体和活动安装在箱体顶部后侧的箱盖；箱体包括前壁、后壁、下壁、两个侧壁和隔板，箱体的前壁、后壁、下壁和两个侧壁组成一个长方体空腔，隔板平行于箱盖且设置在箱体的长方体空腔内前侧，隔板上开有若干用于放置牙椅喷管的圆孔；箱盖和隔板之间安装有用于放置三用枪的三用枪固定架，箱体的长方体空腔内还设置有若干吸管，吸管的一端位于长方体空腔内，吸管的另一端伸出长方体空腔。本实用新型具有结构简单，使用方便，能够以较低成本解决牙科综合治疗椅供水管路和负压管路的污染问题，从而避免牙科交叉感染等有益效果。