本实用新型公开的一种箱式房屋柔性制造系统，包括基座，基座的两侧对称设置有侧壁焊接定位架；所述侧壁焊接定位架上配合波纹板底板的两侧设置有若干个支撑块，所述侧壁焊接定位架的上侧通过若干个支撑柱支撑设置有横压架，所述横压架上配合波纹板竖板的上沿设置有若干个压紧机构；本实用新型通过侧壁焊接定位架可将波纹板的侧壁准确定位在波纹板底板上，避免天车吊住波纹板焊接的晃动情况，提高焊接稳定性和准确性；侧壁焊接定位架对波纹板侧板的定位也可以提高焊接时的安全性。