本实用新型公开了一种疾控中心用医疗垃圾分类处理装置，包括主箱体，所述主箱体的内部开设有左垃圾箱存放仓和右垃圾箱存放仓，左垃圾箱存放仓内放置有常规垃圾箱，右垃圾箱存放仓内放置有消毒垃圾箱。本疾控中心用医疗垃圾分类处理装置，可分类丢弃办公室垃圾、非隔离区非感染性垃圾、新冠病人所使用的一次性物品以及所使用的污物桶，采用消毒喷头对丢入的垃圾进行消毒，可有效降低一次性物品以及所使用的污物桶上附着的病毒二次传播；通过人工将垃圾袋上端打结密封，可杜绝垃圾袋内的病毒向外传播；整体便于将垃圾分类处理，便于对丢弃的垃圾进行消毒，有效的阻断了垃圾上附着病毒的传播路径。