本发明公开了一种煤层气排水的脱氟系统。该系统包括第一沉淀装置、絮凝装置、第二沉淀装置、酸碱度调节装置和污泥收集装置；第一沉淀装置、絮凝装置、第二沉淀装置和酸碱度调节装置依次通过管路连通；污泥收集装置分别与第一沉淀装置、絮凝装置和第二沉淀装置连通；酸碱度调节装置通过外排管路排出达标废水，外排管路上设有打开或关闭其的阀门。该系统通过第一沉淀装置对煤层气排水进行初步沉淀，在絮凝装置中投加药剂，对氟污染物和悬浮物进行吸附絮凝，在第二沉淀装置中絮凝物进一步沉淀排放，该系统处理工艺简单，通过投加药剂对氟污染物和悬浮物进行吸附絮凝和排放污泥等方式，高效去除处理煤层气排水中的氟污染物和悬浮物。