本实用新型提供一种电主轴密封结构，包括转子和密封套，密封套设置于电主轴前轴承和前端盖之间，密封套与转子之间留有间隙，转子上设置有密封台阶，密封台阶由相连的圆柱面和环形面构成，密封套具有多个直接连通圆柱面的第一气道和多个直接连通环形面的第二气道，通过第一气道和第二气道连通气源，多个第一气道的出气口与多个第二气道的出气口在转子的周向上错开设置。形成多层密封气幕，在更加靠近前端盖的第一层密封气幕不均匀的情况下，更加远离前端盖的第二层密封气幕可以对第一层密封气幕原本气压薄弱的部分进行补充，最后形成一个更加均匀的密封气幕。