本实用新型公开了一种鱼稻共生智能控制系统，包括稻田和分布在稻田内的养鱼区；养鱼区的首端通过进气管连通有增氧泵，在进气管上连通有带施料阀门的施料通道，在养鱼区的末端，沿养鱼区的水流方向依次连接有隔网、挡水闸板、集污区、带排污阀门的排污管道、发酵池、净化池、地下管道、稻田；在养鱼区内的底端设置有养鱼区抽水泵；在稻田内、养鱼区的上端设置有与进水管连通的稻田区抽水泵；在养鱼区的一侧设置有压力管道，在压力管道上设置有压力阀；在养鱼区还设置有智能控制设备，在养鱼区的内壁上设置有液位计；稻田区抽水泵和养鱼区抽水泵以及液位计均与PLC电控箱电连接。本实用新型具有成本低、自动化智能控制的特点。