本实用新型涉及棉籽壳仁分离领域，公开了一种高效棉籽壳仁分离机，包括减震垫和仓体，所述减震垫的上方安装有支撑架，所述仓体的左侧安装有分离电机，所述分离电机的上方设置有风道，且风道的上方设置有入料口，所述入料口的右侧安装有鼓风机，且鼓风机的下方设置有出棉口，所述出棉口的右侧设置有出料口，所述分离电机的右侧设置有齿轮，且齿轮的右侧设置有脱料轴，所述脱料轴的下方设置有滚筒，所述风道的内部设置有过滤网，且过滤网的下方设置有传送轮。本实用新型具有以下优点和效果：分离机设置有输送绞龙，可以转动的对棉籽壳仁进行输送收集，并且设置有鼓风机使得分离的产品质量更好，同时设置有传送轮格过滤网使得更加的实用。