本实用新型涉及一种适用于工业菌种保藏的多功能移液器，包括移液器外壳体，所述移液器外壳体的上端设置有储液囊，所述移液器外壳体的下端与移液头连接，所述储液囊包括菌液区、保护剂区和混合液区，所述移液头的下端设置有移液口，各个所述移液口分别与一组泵体连接，所述一组泵体上分别连接有移液管，两根移液管分别连接于菌液区和保护剂区，移液管的下端伸出泵体与移液口连接。本实用新型设置有用于混合菌液和保护剂的混合液区，能够使菌液和保护剂混合更均匀，保证每个菌种管中的菌种和保护剂的含量一致；移液枪头可对同一批次的每支菌种管加液，在保藏的菌种较多时，不需要频繁的更换移液枪头，不易产生漏加或错加的现象，操作便捷。