本实用新型提供了一种畜牧兽医疫病样本采集装置，包括：盒体、盒盖、护垫；所述盒体的上部设置有盒盖，且盒体与盒盖通过铰接方式相连接；所述护垫分别设置在盒体与盒盖的内部，且护垫分别与盒体及盒盖通过间隙配合套接；所述固定孔位于护垫的内部，且固定孔与护垫为一体式结构；所述瓶体设置在固定孔的内部，且瓶体与固定孔通过间隙配合插接；所述瓶盖设置在瓶体的上部，且瓶盖与瓶体通过螺纹拧接。通过在结构上的改进，具有疫病样本采集操作较为方便，且干净卫生，同时具备较强的样本防护性能，大大提高其实用价值等优点，从而有效的解决了本实用新型提出的问题和不足。