本实用新型提供一种增压泵本体结构及微型泵，其中，增压泵本体结构包括第一泵体、第二泵体以及柱塞；第一泵体具有与内部连通的至少两个流道，第二泵体具有与内部连通的至少另外两个流道，第二泵体装配于第一泵体的一端。其中两个相互配合的流道间设置有增压腔，增压腔由进口阀和出口阀进行打开或者关闭，柱塞安装于增压腔中，其两端由位于增压腔中的柱塞密封件进行支撑固定，且柱塞密封件对柱塞与第一泵体和第二泵体之间的间隙进行密封，实现两个分别独立增压腔。本实用新型采用分体设置的第一泵体和第二泵体，结构简单，成本减低，有利于增压泵的组装和拆卸效率。