本实用新型涉及一种水体本底微生物强化装置，包括：壳体、循环泵、红外发生器、微纳米曝气机和营养液投加设备，其特征在于：红外发生器安装在壳体的内壁上，循环泵、微纳米曝气机和营养液投加设备安装在壳体四周上集成成一体，循环泵的进水口连接到待处理水体，循环泵的出水口连接到壳体内，壳体的排水管连接到待处理水体；微纳米曝气机的曝气管安装在壳体内，营养液投加设备的出料口连接到壳体内。本实用新型利用红外光照射，微纳米曝气增氧及营养液的添加，达到水体本底微生物的最佳生长环境，来实现黑臭水体的自我修复。操作管理方便，人员需求量低，运行费用较低，环境效益、社会效益、经济效益明显。