本实用新型涉及隧道工程领域，特别是一种穿越活动断裂带的隧道变形缝的结构、构造及防水系统，其中，防水结构，背贴止水带，沿所述第一变形缝延伸方向设置；第一中埋止水带，设且沿所述第一变形缝延伸方向设置，第一填充层，填充于所述背贴止水带和所述第一中埋止水带之间；引排水管，所述引排水管位于所述第一中埋止水带靠近隧道内的一侧，所述引排水管靠近所述第一中埋止水带的一侧敞口设置，所述二次衬砌、所述第一中埋止水带和所述引排水管围成用于排水的通道。本申请所述的一种穿越活动断裂带的隧道变形缝的结构，能够更有效地防止外侧的水进入隧道，以达到位于高烈度地震区的隧道的防水要求。