本申请公开了一种低能耗防堵塞的生化电解除磷装置，包括用于容纳电解质溶液的箱体和设于箱体内的电极片，所述电极片为Fe系电极片或/和Al系电极片，所述电极片通过导线外接电源；所述箱体的底面及至少部分侧面带有由阳离子交换膜构成的窗口。先在箱体侧面开口，在开口边缘放置一层硅胶，将阳离子交换膜放在硅胶上，再在相同位置再次放置一层硅胶，最后加上一层有机玻璃片，有机玻璃片和箱体之间通过螺栓和螺母相连，用相同方法在筒体其他侧面和底面进行相同操作。本申请的生化电解除磷装置降低能耗的同时解决电极片堵塞问题。