本实用新型公开了一种藻基水处理器，包括设备壳体，所述设备壳体包括中心筒外筒、安装于中心筒外筒底部的泥斗和安装于中心筒外筒内的中心筒内筒，所述中心筒外筒上设置有伸入到中心筒内筒底部的进水管以及位于设备壳体侧部顶端处的出水管，所述中心筒外筒内设置有分离区以及位于分离区下方的纳米硅藻过滤层，所述中心筒内筒内设置有搅拌机。本实用新型通过特殊的结构设计配合纳米硅藻复合净水剂的特性，使得污水中的纳米硅藻复合净水剂会在分离区处自然形成纳米硅藻过滤层，纳米硅藻过滤层的形成巧妙的解决了原先存在的污水和纳米硅藻复合净水剂接触面积小、接触不全面等问题，使得纳米硅藻复合净水剂的净水效果发挥至极致，提升了水处理效果。