本实用新型提供了一种啮齿动物断头器，包括操作台、切刀、第一固定架、第二固定架和升降装置，操作台包括台板及其下端安装的若干支腿，台板上端设有第一滑槽、第二滑槽和第三滑槽，第二滑槽和第三滑槽相互平行设置，第一滑槽与第二滑槽垂直设置，且第一滑槽分别与第二滑槽、第三滑槽相交，台板中部设有第一通孔，第一通孔底部外缘安装升降装置，切刀底部穿过第一通孔固定连接至升降装置上端，第一固定架底部卡接至第三滑槽，第二固定架底部卡接至第二滑槽。本实用新型所述的啮齿动物断头器，固定装置内配有气囊，可以通过打气膨胀气囊固定动物，这样既可以起到固定作用，又可以防止损害动物脑组织等身体器官。