本申请公开了一种生物有机肥处理设备，包括下料斗，下料斗的上端安装有下料架，下料斗内的侧壁上固定有多个疏导机构，下料斗的底部安装有集料箱，集料箱内安装有第一螺旋绞龙，集料箱的底部一侧设有下料口，下料口处安装有过滤箱，过滤箱内的相对侧壁上安装有两个转轴，两个转轴的一端安装有第一驱动机构，且两个转轴的转动方向相反，转轴上固定有过滤杆，过滤箱内的相对侧壁上固定有两个筛板，两个筛板分别位于两个转轴的两侧。本申请能够减少传统有机肥生产中的大量人力，且生产出的有机肥湿度低，便于运输，颗粒均匀发酵质量好，根据不同土壤的要求添加不同的有益菌群，便于使用，且有机肥中垃圾含量较低，施肥的过程中不会对农田造成影响。