一种便携式精子样本孵育器，包括孵育箱，孵育箱的底部中间位置固定设置有连接套管，孵育箱内固定设置有用于将精子样本摇匀的旋转震荡装置，旋转震荡装置包括动力电机、旋转轴、冷冻管存放机构，孵育箱的底部固定设置有用于对孵育箱内的水进行加热的加热丝；通过设置的加热丝可以对孵育器内的水进行加热，为冷冻管内的精子样本提供预热，通过设置的动力电机电动带动冷冻管存放机构转动，可以将冷冻管内的精子摇匀，并能够同时搅动孵育器内的水，使孵育器内的水温均匀，这样可以使精子样本在摇匀的同时又可以处于恒温状态，本实用新型在保证一定的孵育效果下，而且操作简单，大大提高了医护人员的操作效率。