本实用新型公开了一种生物医药搅拌装置，属于生物医药技术领域，包括旋转座，所述旋转座的内部设置有放置槽，且所述的放置槽的外壁与旋转座的内壁转动连接，所述放置槽上设置有搅拌仓，所述搅拌仓的内部设置有搅拌机构，且所述的搅拌机构的顶部设置有转动头，所述转动头的外壁设置有传动机构，且传动机构延伸于转动头的内部。本实用新型通过将生物医药物料倒进搅拌仓中，启动动力机构，动力机构带动驱动轴和放置槽转动，驱动轴带动驱动齿轮转动，通过第一传动齿轮柱和第二转动齿轮柱将动能传动给搅拌齿轮，搅拌齿轮通过转动轴将动能传导给齿轮环转动，进而实现搅拌桨和搅拌轴都可以对生物医药物料进行搅拌。