本实用新型公开了一种生化分析仪用搅拌装置，包括底板和盖板，所述底板顶部一端焊接有连接板，且连接板靠近底板一侧外壁顶部焊接有顶板，所述顶板底部安装有气缸，且气缸活塞杆底部焊接有安装板，所述安装板底部通过螺栓固定有马达，且盖板顶部中心位置处插接有套接轴承的连接杆，所述连接杆远离盖板一端通过联轴器与马达输出轴连接，且连接杆底部外壁上开有横截面为正六边形的凹槽，所述凹槽内壁上安装有磁铁，且凹槽内壁上磁吸有六棱柱磁铁。本实用新型该装置的凹槽和六棱柱磁铁的设计可以十分方便的在搅拌完之后将搅拌轴取下，对搅拌轴和搅拌杆进行清洗防止残留在上面的液体在下一次搅拌中混合到其他的样品中影响检测结果。