本实用新型涉及基因检测设备技术领域，公开了一种柜式排风PCR装置，包括：柜体，柜体开设有进风口以及出风口，其中进风口位于出风口的下方；PCR仪工作区，设置于柜体的内部，处于从进风口向出风口单向流动的气流中；高效过滤单元，填充出风口，高效过滤单元构成为能够对经过出风口的气体进行过滤。本柜式排风PCR装置通过将各实验设备集成在柜体内部，能够彼此有机、协调地工作以发挥出整体效益，达到整体优化的目的。PCR实验在柜体内部封闭式地进行，也降低了有害物质溢出的可能性，使得柜体内部的空气出口仅为出风口，再利用高效过滤单元将空气过滤净化后排出至柜体的外部，保证柜体内部实验环境的洁净，也有助于PCR实验的进行，提高实验效率。