本实用新型公开了一种面粉发酵菌培养系统，包括发酵箱、连接线和温度调节器，所述发酵箱底部左右两侧均固定有垫架，所述抽拉板上端面的前后两侧均卡合连接有培养皿，所述连接线固定在抽拉板和支架上，所述连接线的左端固定在插头上，所述插座固定在控制面板的右端面，所述温度调节器贯穿固定在发酵箱的顶部，且温度调节器的顶部固定有进气通道，所述进气通道的内侧通过螺栓固定有甲醛过滤网、有害菌过滤网和活性炭过滤网，且甲醛过滤网和活性炭过滤网分别设置在有害菌过滤网的上下两侧。该面粉发酵菌培养系统，发酵箱内部可在温度调节器的作用下保持在合适的温度范围内，使面粉发酵菌处在最佳温度下进行培养。