本实用新型公开了一种生化与氧化并联互备式的医疗废水处理系统，其中，预消毒池、化粪池、提升泵站和调节池依次串联连通，生化池和光催化氧化系统并联设置且两者进口端分别通过第一电动阀和第二电动阀与调节池连通，出口端均与沉淀池、二次消毒池和出水泵站依次串联连通；调节池中安装有余氯监测仪、COD第一在线监测仪和亚硫酸钠加药泵，生化池中安装有COD第二在线监测仪，各监测仪、电动阀和加药泵分别与集中控制器相连接。通过本实用新型的技术方案，出水余氯控制平稳、COD达标，确保出水稳定达标、避免生态崩溃，提高了医疗废水处理系统的稳定性，提高了自动化水平，降低了综合运营成本。