本实用新型公开了一种生物制药用分层粉碎装置，包括机箱，所述机箱顶端设置有粉碎筒，所述机箱上表面设置有固定板，且与粉碎筒的外壁通过螺栓连接，所述粉碎筒的顶端设置有进料口，所述机箱下表面四角处均设置有支撑柱，所述机箱右侧外表面底端设置有箱门，所述机箱右侧外表面顶端设置有托板，所述托板的顶部后侧设置有敲打机构，所述托板上表面前端设置有第三电机，且与敲打机构可拆卸设置，所述粉碎筒的后侧中部设置有第一电机。该生物制药用分层粉碎装置，在实际使用时，粉碎更加细致，无需反复操作省时省力，另外，可对过滤网敲打，避免生物小颗粒物料阻塞过滤网，确保生物粉碎的正常进行。