本实用新型公开了一种通风柜用杀菌结构，包括柜体，所述柜体的顶部固定连接有杀菌箱，所述杀菌箱内壁底部的中心处固定连接有气缸，所述杀菌箱的内腔且位于气缸的顶部横向固定连接有连接板，所述气缸的顶部贯穿连接板的底部固定连接有固定板，所述固定板的左侧和右侧均通过转轴活动连接有活动杆，所述连接板内腔的左侧和右侧均滑动连接有传动机构。本实用新型通过使用者启动气缸往复运动，气缸带动固定板上下移动使活动杆以转轴为中心旋转折叠，活动杆旋转带动连接柱往内侧移动，解决了现有的通风柜杀菌不均匀导致工作效率降低的问题，增加了通风柜的适用性，也提高了通风柜的环保的作用，也增加了通风柜的实用性。