本实用新型公开了一种水族箱恒温控制系统，包括恒温水箱、加热水箱、加热模块、散热模块、恒温箱水泵、加热箱水泵、控制模块和温度检测模块。加热水箱和控制模块固定在恒温水箱的外侧面。控制模块包括51单片机核心芯片U1、接口电路、按键电路和继电器电路。加热箱水泵放置在加热水箱的底部，加热模块悬空放置在加热水箱中。恒温箱水泵和散热模块放置在恒温水箱的底部。温度检测模块与控制模块相连，由4个温度传感器组成。本实用新型可以实现对恒温水箱中水体的自动加热，与传统的温控系统相比，利用散热模块形成强制对流进行水循环加热，加快水的流动，缩短温度上升时间、水温交换充分，整体耗能较低。