本实用新型涉及一种浮水自灌式水质净化装置，包括箱体，所述箱体的前部、后部分别布置进水口、出水口，所述箱体外连接浮水支撑体，所述箱体内从进水口至出水口间依次设置生物填料区、沉淀区、排水泵；所述生物填料区与沉淀区之间用隔板分隔，所述隔板的顶部高于所述生物填料区的填料顶面；所述生物填料区的底部均匀曝气出口。本实用新型的有益效果是让净化装置漂浮于目标水体中，河水通过设置在装置前端的进水口自动灌入净化装置生物填料区，可对污染严重区域有针对性地进行净化，并保持整个水体长效可靠的净化效果。