本实用新型公开了一种荧光免疫分析系统，属于医学检测技术领域。它包括荧光免疫分析仪和检测卡，检测卡包括检测区和标识区，标识区上设有记载用户ID的标识码；分析仪包括：传送单元，用于将插入的检测卡传送到第一位置、第二位置；标识读取单元和光电检测单元，依次设置在与第一位置、第二位置相对应的位置，分别用于读取标识码、检测检测卡上的待测物浓度；与传送单元、标识读取单元和光电检测单元均通讯连接的控制分析单元，用于发送控制指令、接收反馈信号，并生成与用户ID对应的检测结果；以及与控制分析单元连接的，用于将检测结果发送到与用户ID相对应的用户终端的数据传输模块。本实用新型减少了等待时间，且检测结果具有隐秘性。