本实用新型涉及一种水质微生物检测用取样装置，包括水样采集系统，其特殊之处在于，所述的水样采集系统包括浮子，安装在浮子中心的调节直管，调节直管的下端设置水下混水仓；调节直管的外壁上设置带有多个销孔的定位板条，T形调节滑块套装在调节直管上，且调节滑块上设置有与定位板条配合的耳板和用于连接定位板条与耳板的插销；多根张合杆的一端铰接安装在调节滑块上，调整支杆一端铰接安装在水下混水仓上，调整支杆的数量与张合杆的数量相同，调整支杆的另一端铰接安装在调整支杆的中部；多根进水软管的一端安装在水下混水仓上，另一端固定在张合杆的端部。本申请通过简单的结构，实现对河流、湖泊这类水体中的微生物实现在线检测。