本实用新型涉及一种浮球式双向截止阀控制系统，包括排水管道、安装在排水管道上的真空阀及控制真空阀启闭的双向截止浮球；所述双向截止浮球内部设置有双向截止阀，所述双向截止阀具有与大气相连通的大气进气口、与排水管道相连通的负压进气口及与真空阀相连通的真空阀连接口，内部设置有分别单独密封大气进气口及负压进气口的重力钢珠；本实用新型中真空阀的启闭通过双向截止阀进行控制，采用了纯机械结构，不会产生电源压降等缺陷，整体结构简单，原理可靠，没有运行成本；同时双向截止阀为本实用新型的核心部件，其安装在密封的双向截止浮球内部，不受气候与使用环境的影响，保证了核心部件的使用寿命。