本实用新型公开了一种具有医学防护功能的试剂样品双层存放盒，包括存放盒主体、盒盖以及消毒容器，所述存放盒主体的外部设有纳米抗菌结构的外壳，所述存放盒主体内部中间设有隔离板，并通过隔离板形成有样品室，所述样品室内部通过限位卡槽卡装有样品盒；所述消毒容器设于隔离板的中心，且消毒容器的顶部通过按压泵连接有输出管；盒盖与存放盒主体的顶部覆盖密封卡装，所述盒盖与输出管对应处设有橡胶层，并通过橡胶层对应输出管设有喷头，所述喷头的输入端通过套管与输出管的末端套装连接。具有医学防护功能的试剂样品双层存放盒，通过双层设计，便于对样品取放使用，并便于对存放盒内部消毒操作，提高存放盒使用便捷性的优点。