本实用新型公开了一种肉苁蓉种子筛选机，包括筒体A部和筒体B部，所述筒体A部和筒体B部为相互匹配的半筒状，所述筒体A部和筒体B部的中间水平固定有隔板，所述隔板上端插入有与筒体A部和筒体B部顶部滑动连接的竖杆，所述竖杆的顶部水平固定有横板，所述横板之间安装有相互匹配的卡扣，所述横板和所述筒体A部与筒体B部之间分别设有弹簧，所述竖杆的底部水平固定有刮板，将穗状花部全部包裹后通过按压横板即可有效的刮下下端种子，省时省力快捷高效，收集后通过过滤板即可进行有效的筛选简单方便，保留肉苁蓉花穗中直径较大成熟度更高的种子可以有效的提高种植的成活率，符合规模化、规范化种植的标准。