本实用新型公开了一种法兰钻孔机构，包括底座以及用于安装固定法兰的固定装置，在支架上设置用于压紧法兰的侧面压紧装置；所述固定装置包括固定台、固定螺杆、压板、上固定螺母和下固定螺母；所述固定台置于底座上，固定螺杆的上端部与上固定螺母螺纹连接，下端部依次穿过压板、固定台和底座与下固定螺母螺纹连接；侧面压紧装置包括压块、螺钉和压紧螺母，所述螺钉的一端部置于支架外并且设置有手柄，另一端部穿过支架的压紧螺纹孔与压块相连接；旋转上固定螺母驱使压板压紧法兰固定在固定台上，此时旋转手柄，驱使压块压紧法兰侧面，并且旋转压紧螺母，压紧支架侧面，解决传统采用需要人工对待加工的法兰片进行扶持钻孔，有效保证法兰钻孔精度。