本实用新型提供了一种用于信号控制设备的启动保护系统，其可解决存在某些非法操作而导致开机失败，信号控制设备不能正常上电开启工作的问题，稳定性高；其包括信号控制设备的电路主板，电路主板上接有北桥PCH芯片以及为信号控制设备供电工作的电源模块，电路主板上还接有保护模块、控制模块，电源模块与保护模块电连接，且控制模块经保护模块后与北桥PCH芯片电连接，电源模块包括装于电路主板上的电池座BH1及接于电池座内的纽扣电池BAT1；其中，控制模块，用以控制保护模块作出响应；保护模块，用以接收控制模块发出的触发信号，以使北桥PCH芯片断电而初始复位，使得信号控制设备重启开机。