本实用新型公开了一种新型兽医站用消毒装置，包括底座，所述底座的顶端固定连接有支撑罩，所述支撑罩的顶端均匀开设有多双鞋槽，所述支撑罩的外侧壁对应每双鞋槽的位置均固定连接有气缸，且气缸的活塞端贯穿支撑罩的外侧壁延伸至其内侧，多个所述气缸的活塞端均固定连接有传动座。本实用新型中，通过工作人员根据自己鞋的尺码选择支撑罩上合适的鞋槽踩入，接着通过按下相应一侧的支杆上的开关启动第二电机以及对应的气缸与第一电机，气缸带动传动座沿着限位杆在支撑罩内来回移动，从而使电机罩内的第二电机驱动刷头快速转动，同时喷头通过导管与伸缩管将储液箱内的消毒液喷向刷头与鞋底，从而便于完成对鞋底的较为充分的消毒工作。