本实用新型公开了一种蜂巢式发酵消化装置，包括：一蜂巢式发酵消化仓，包括组成蜂巢结构的n个正六边形筒体；多个溢流口，分别设置在两两筒体相邻的侧壁上，用于连通各个筒体以形成Z形物料流动路径；一进料口，开设于Z形物料流动路径起始端所在筒体的侧壁上；一出料口，开设于Z形物料流动路径终止端所在筒体的侧壁、并靠近顶部的位置；一出渣口，开设于Z形物料流动路径终止端所在筒体的侧壁上，并位于出料口的下方；多个曝气管，每个曝气管为U形，其管体上连通设置有多个曝气支管，各个曝气支管的出口分别通至各个筒体中，用于为各个筒体供气。解决了现有技术中待处理液体生料与半熟料相互渗透从而不能达到成品要求的缺陷。