本实用新型公开了一种磁刺激仪手柄线圈，包括线圈本体和填充层，所述线圈本体为上下间隔平行设置的两层结构，分别为位于上层的线圈一和位于下层的线圈二，所述填充层位于线圈一和线圈二之间；还包括呈平面螺旋形式裹覆在填充层内部的冷液管以及嵌设在填充层内部的一组硅胶片。本实用新型采用平面螺旋结构的线圈本体和冷液管管配合以填充层的结构设计，更好地将线圈产生的热量传递至冷液管形成循环散热，散热效果更好，同时冷液管为硅胶制成，制作成型更为简单，适宜广泛推广应用。