本实用新型涉及一种兽医专用传染病防治恒温式菌株培养装置，包括恒温箱、保温板和密封培养柱，恒温箱上端敞口，其内设置有开口向上的第一腔体，第一腔体的外侧壁和底壁为隔层，隔层与恒温箱的内侧壁及底部之间构成开口向上的第二腔体，隔层的上端部与恒温箱的上端部通过连接杆固定连接；保温板置于恒温箱的上端，并与恒温箱的上端部密封连接，保温板密封第一腔体和第二腔体；恒温箱的一侧壁上设置有电加热器，电加热器的加热端伸入第二腔体内；保温板上设置有自动密封装置；密封培养柱竖直置于保温板上，密封培养柱穿过自动密封装置伸入第一腔体内。本实用新型能实现对密封培养柱实时密封，降低了传染病菌外泄的可能性，提升安全可靠性。