本申请实施例提供了一种标定装置，包括：底座和标定结构；标定结构设置在底座上，标定结构用于容置待标定工具，以对待标定工具进行标定；底座上还设置有第一标识，第一标识用于被传感器模块感应，得到指示标定装置位姿的位姿数据，以配合标定结构对待标定工具进行标定，位姿数据包括标定装置的位置数据和标定装置的姿态数据。本申请实施例所提供的标定装置体积小，可以手持固定，使用方便，可以标定多种自定义手术工具上固定位置的特征点与手术工具的相对位姿关系，有效的避免将工具的加工误差，形变误差等带入的手术导航系统中，提高了导航的精度。