本实用新型提供一种自动清洁对辊破碎机，其包括：安装于机架顶部的给料机构、设在给料机构下游的接收给料机构的样料并进行破碎的对辊破碎机构，用于安装所述给料机构和对辊破碎机构的机架，在所述对辊破碎机构下端的出料口的下方设有一自动进出样瓶的放置样瓶机构；其还包括一个清洁机构，所述清洁机构包括设在所述对辊破碎机构的下方的出料口除尘组件，以及一个进料口除尘组件，用于当放置样瓶机构上的样瓶离开接料位置、处于给/取瓶位置时，对对辊破碎机构进行清洁。本实用新型所述自动清洁对辊破碎机有效避免了样料交叉污染，能够提高制样的纯净度。