本实用新型公开了一种带有保护结构的细胞冷冻管，包括细胞冷冻管，细胞冷冻管的顶端固定设有圆形连接块，圆形连接块顶端的中部固定设有螺纹套，螺纹套的的顶端螺纹连接有密封盖，细胞冷冻管的外壁套设连接有透明保护套，透明保护套的顶端等距固定设有多个插块，圆形连接块底端的边侧等距开设有多个插孔，多个插块与对应的插孔穿插连接，多个插块的一侧均开设有插槽。本实用新型通过设有的透明保护套与细胞冷冻管之间形成夹腔，通过向夹腔内部加入冷却液体，使细胞冻存液缓慢降温，便于细胞冻存液直接放置入液氮罐的内部，避免力放置入冰箱内部放置后在转入液氮罐的内部，有效的解决了细胞冻存繁琐和缓慢降温的问题。