本实用新型公开了一种新型负压抽滤式集菌仪，包括废液收集罐、集菌器和进料软管，所述废液收集罐内部装配有液位报警器和泄压装置，废液收集罐顶部连接有进液管和抽气管，所述废液收集罐位于真空抽滤装置和排液槽之间，且真空抽滤装置与脚踏开关相连，所述排液槽之内部安装有压力调节装置，排液槽之前侧面上安装有调节旋钮，排液槽之顶部设置有安装槽，所述集菌器上下两端上分别设置有呼吸孔和出液孔，集菌器内部设置有过滤膜，所述插接口与出液孔插接在一起。该新型负压抽滤式集菌仪，结构设置合理，通过设置真空抽滤装置提供负压，当废液收集罐内达到设定压力后，真空泵停止工作，避免了正压导致的培养器炸裂的安全问题。