本实用新型涉及一种变频旋磁诱变育种箱，包括箱体、铁芯、三相绕组线圈、接线盒、变频器、控制系统和育种架，铁芯竖向设在箱体内，铁芯由数片环形硅钢片叠成，中间形成空腔，铁芯的内圆周均匀设有数条绕线槽，三相绕组线圈采用链式绕法均匀绕设在绕线槽内，三相绕组线圈的出线端与接线盒内的接线柱相连，接线盒与变频器相连，变频器与控制系统相连；育种架设在铁芯内部的空腔。本实用新型接入三相交流电源，通入三相交流电时，在每个线圈中产生磁场，这三个磁场合成得到一个旋转磁场；电流完成一次全振动，旋转磁场正好旋转一周；改变旋转磁场的磁感应强度、旋转速度以及频率，对实验目标物进行磁场诱变，研究不同磁场强度对作物种子诱变的效果。