本实用新型公开了一种凝胶电泳用玻璃板清洗装置，包括盒盖和盒体，凝胶电泳用玻璃板清洗装置通过盒体内部的放置架，从而便于将待清洗的玻璃板集中排列放置在带有放置架的盒体结构中进行清洗，放置架隔板的每个凹槽左右两侧有用于夹持玻璃板的夹持结构，一侧内置清洗板条以及用于驱动所述清洗板条左右或上下移动的传动机构，隔板前后设置有多个用于喷出液体的喷头，从而启动时可由喷头向玻璃板喷水进行清洗，而清洗后，通过盒盖结构上增设的送风装置，从而加速玻璃板的干燥，通过该装置可省去手持玻璃板逐个清洗的繁琐操作，避免用力不当破碎，同时可加速玻璃板的干燥速度，从而使凝胶电泳用玻璃板的清洗更加便捷高效，提高实验效率。