本实用新型涉及一种间充质干细胞制备装置，包括箱体、箱门，其中：箱体两面均通过合页铰接安装有箱门，箱体内设有控制系统，控制系统包括有控制面板，控制面板连接有显示屏和温度传感器，控制系统下方还连接有无菌腔，无菌腔下底面安装有紫外消毒灯，箱体内设有安装在无菌腔下方的粉碎腔和提取腔，提取腔包括有反应室和冻存室，反应室上壁面焊接有存储室，反应室下方安装有传动通道，传动通道连接并延伸至冻存室内，传动通道下方设有培养皿，冻存室外壁安装有液氮开关阀，液氮开关阀连接有液氮罐。本实用新型结构简单，操作方便，可以保证在转移组织的过程中整个箱体保持无菌环境，同时能够将制备完成的间充质干细胞迅速冻存，提升生产效率。