本实用新型涉及自动化设备技术领域，尤其是一种移液吸头自动装盒机，包括吸头分离机构、双通道输送轨道、接料推料模块、规格切换模块、吸头定位落料模块、吸头盒堆栈存储模块和吸头盒移载模块，吸头分离机构中分离的吸头通过双通道输送轨道移动至接料推料模块前，规格切换模块切换指定规格的吸头输出，接料推料模块将吸头等距排列并推至吸头定位落料模块中，吸头定位落料模块接住并定位吸头后落入装盒工位完成装盒，吸头盒移载模块将装满吸头的吸头盒移载至吸头盒堆栈存储模块的满料位，吸头盒移载模块将吸头盒堆栈存储模块的空盒位中空吸头盒移载至吸头定位落料模块的下方的装盒工位，本实用新型不仅可以减少劳力和时间，还能提高工作效率。