本实用新型提供一种无损水稻育种脱粒机，涉及脱粒机技术领域，包括箱体，箱体顶部的左右两侧均固定连接有侧板，箱体顶部的中间位置通过连通口连通有入料斗，两个侧板相对的一侧之间且位于入料斗的上方设置有脱粒机构，脱粒机构包括横杆和弹簧，横杆设置有两个，弹簧设置有两个。通过在箱体的顶部增设了脱粒机构，横杆之间设置有卡条，将水稻分成几组放置于卡条之间，弹簧的作用力下，使得两个横杆向中间移动，代替人工进行放料，并且由于横杆可在侧板之间上下移动，脱粒筒在电机的带动下，两个脱粒筒相互转动，对进入入料斗的水稻进行脱粒，由于水稻向上运动时的反作用力，可以使得脱粒速度更快，并且更加细致，更具有实用性。