本实用新型公开一种室内交叉感染风险的诊断系统，其包括设置于使用者日常所处的一室内环境的一监测终端装置，其中监测终端装置包括一传感器模块以及一处理器。传感器模块用以监测室内环境的多个交叉感染风险指标，多个交叉感染风险指标包括悬浮微粒浓度、二氧化碳浓度以及湿度，处理器用以根据多个交叉感染风险指标判断出室内环境的交叉感染风险等级。本实用新型的室内交叉感染风险的诊断系统可进一步包括一正压式新风设备，用以使室内环境与外界进行空气流通，进而降低室内环境的交叉感染风险等级。