本实用新型公开了一种牙刷消毒自动清洗无菌杯，包括杯体、杯盖、固定支架、底座、下离合器及上离合器；固定支架设置于杯体的内底部；底座内设置有电机、底座控制模块、供电模块，底座顶部设置有便于杯体底部卡接的卡槽，下离合器安装于电机的输出轴上且位于卡槽内；上离合器顶部的传动轴贯穿杯体的底部并与固定支架固定连接；杯盖包括盖体、电源、第一紫外灯模块、压力开关，电源用于给第一紫外灯模块及压力开关供电，压力开关用于控制第一紫外灯模块供电的通断。第一紫外灯模块可实现同时对牙刷和杯体进行杀菌消毒，确保用户使用的牙刷和杯体都是无菌的；电机转动进而带动牙刷高速旋转，可将刷牙刷头内的水和污渍甩出，提高清洁效率。