本实用新型公开了一种具有保护结构的皮肤吻合器，涉及医疗器械技术领域。本实用新型包括固定座，固定座一端的上表面固定有皮肤夹持机构，皮肤夹持机构包括有固定壳、螺纹柱、旋钮、升降块、夹座、两个推片、四个限位杆与两个螺纹杆，固定壳固定在固定座的上表面，固定壳的内部转动连接有螺纹柱，旋钮固定在螺纹柱顶端，升降块位于螺纹柱外侧，且升降块位于固定壳内部。本实用新型通过固定壳、螺纹柱与升降块配合，使得装置能够根据患者伤口深度调节高度，进而能够对患者不同高度的皮肤进行挤压闭合，更加便于使用，通过防护气垫能够防止装置对患者的手臂造成损伤，并且能够使得装置固定更加紧固，更加安全。