本实用新型公开了一种电子气流仪控制系统，包括控制盒体，控制盒体内安装有控制电路板，控制电路板上安装有处理器、电源模块、数据模块和通讯模块；所述控制电路板通过安装元件安装在控制盒体内；所述控制盒体的后端面上设置有进风口和保护过滤网罩；进风口上设置有过滤进风装置；控制盒体的两个侧面分别设置有出风口，出风口上设置有侧保护过滤网罩；所述控制盒体的侧面上设置有数据接口盒。本实用新型结构简单，实现内部控制电路板的工作环境的保护，这样就实现了整个电子气流仪的控制的功能齐全，控制精准，具备了通风散热和空气过滤的辅助功能，实用性能好。